MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 1

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019975	GA	3	6	115	120	50 %	0 %	50 %	0 %	435849357
2	NC_019975	CGA	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849357
3	NC_019975	GAA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849357
4	NC_019975	GAC	2	6	223	228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849357
5	NC_019975	GAC	2	6	261	266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849357
6	NC_019975	AGT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849357
7	NC_019975	CGA	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849358
8	NC_019975	TCG	2	6	363	368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849358
9	NC_019975	TGA	2	6	475	480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849358
10	NC_019975	TGAT	2	8	594	601	25 %	50 %	25 %	0 %	435849358
11	NC_019975	CGG	2	6	620	625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849358
12	NC_019975	CGT	2	6	655	660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849358
13	NC_019975	GAG	2	6	671	676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849358
14	NC_019975	CTAA	2	8	1310	1317	50 %	25 %	0 %	25 %	435849359
15	NC_019975	TGGGG	2	10	1340	1349	0 %	20 %	80 %	0 %	435849359
16	NC_019975	TCGG	2	8	1367	1374	0 %	25 %	50 %	25 %	435849359
17	NC_019975	AAACC	2	10	1449	1458	60 %	0 %	0 %	40 %	435849359
18	NC_019975	CGA	2	6	1480	1485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849359
19	NC_019975	CCG	2	6	1506	1511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849359
20	NC_019975	GAG	2	6	1520	1525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849359
21	NC_019975	CAA	2	6	1558	1563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849359
22	NC_019975	CGA	2	6	1570	1575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849359
23	NC_019975	TCG	2	6	1704	1709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849359
24	NC_019975	ACTA	2	8	1736	1743	50 %	25 %	0 %	25 %	435849359
25	NC_019975	ACT	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849360
26	NC_019975	ACG	2	6	1826	1831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849360
27	NC_019975	TCG	2	6	1891	1896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849360
28	NC_019975	TGT	2	6	1911	1916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849360
29	NC_019975	TC	3	6	2014	2019	0 %	50 %	0 %	50 %	435849360
30	NC_019975	GAG	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849360
31	NC_019975	TTC	2	6	2060	2065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849360
32	NC_019975	GGA	2	6	2067	2072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849360
33	NC_019975	TC	3	6	2163	2168	0 %	50 %	0 %	50 %	435849360
34	NC_019975	GCA	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849360
35	NC_019975	CGA	2	6	2196	2201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849360
36	NC_019975	CCGT	2	8	2255	2262	0 %	25 %	25 %	50 %	435849360
37	NC_019975	TCGA	2	8	2275	2282	25 %	25 %	25 %	25 %	435849360
38	NC_019975	TGG	2	6	2342	2347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849360
39	NC_019975	ACC	2	6	2372	2377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849360
40	NC_019975	GAC	2	6	2406	2411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849361
41	NC_019975	TAG	2	6	2519	2524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849361
42	NC_019975	ACG	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849361
43	NC_019975	CAG	3	9	2725	2733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849361
44	NC_019975	ACT	2	6	2776	2781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849361
45	NC_019975	GCG	2	6	2807	2812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849362
46	NC_019975	CGA	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849362
47	NC_019975	CA	3	6	2847	2852	50 %	0 %	0 %	50 %	435849362
48	NC_019975	AGG	2	6	2886	2891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849362
49	NC_019975	GAA	2	6	3089	3094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849363
50	NC_019975	ACGA	2	8	3195	3202	50 %	0 %	25 %	25 %	435849363
51	NC_019975	GAA	2	6	3308	3313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849363
52	NC_019975	AAT	2	6	3327	3332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849363
53	NC_019975	ACG	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849364
54	NC_019975	CGAC	2	8	3519	3526	25 %	0 %	25 %	50 %	435849364
55	NC_019975	GAG	2	6	3529	3534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849364
56	NC_019975	TGA	2	6	3540	3545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849364
57	NC_019975	GA	3	6	3937	3942	50 %	0 %	50 %	0 %	435849365
58	NC_019975	CGG	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849365
59	NC_019975	TGA	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849365
60	NC_019975	AGT	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849366
61	NC_019975	AT	3	6	4076	4081	50 %	50 %	0 %	0 %	435849366
62	NC_019975	TCG	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849367
63	NC_019975	TCGA	2	8	5212	5219	25 %	25 %	25 %	25 %	435849367
64	NC_019975	CAC	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849367
65	NC_019975	GCG	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849367
66	NC_019975	TTC	2	6	5292	5297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849367
67	NC_019975	CTC	2	6	5322	5327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849367
68	NC_019975	TTC	2	6	5702	5707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849368
69	NC_019975	TCA	2	6	5745	5750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849368
70	NC_019975	ACC	2	6	5757	5762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849368
71	NC_019975	CGG	2	6	5863	5868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849369
72	NC_019975	GTTC	2	8	5871	5878	0 %	50 %	25 %	25 %	435849369
73	NC_019975	GCT	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849369
74	NC_019975	CGCT	2	8	5899	5906	0 %	25 %	25 %	50 %	435849369
75	NC_019975	CG	3	6	5925	5930	0 %	0 %	50 %	50 %	435849369
76	NC_019975	CGG	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849369
77	NC_019975	TCG	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849369
78	NC_019975	GGT	2	6	6019	6024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849369
79	NC_019975	TTG	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849370
80	NC_019975	CGG	2	6	6215	6220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849370
81	NC_019975	TCG	2	6	6238	6243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849370
82	NC_019975	TCCG	2	8	6265	6272	0 %	25 %	25 %	50 %	435849370
83	NC_019975	CGA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849371
84	NC_019975	GTTC	2	8	6562	6569	0 %	50 %	25 %	25 %	435849371
85	NC_019975	CAC	2	6	6586	6591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849371
86	NC_019975	GAG	2	6	6656	6661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849371
87	NC_019975	CTT	2	6	6698	6703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849371
88	NC_019975	CGAG	2	8	6711	6718	25 %	0 %	50 %	25 %	435849371
89	NC_019975	CGA	2	6	6798	6803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849372
90	NC_019975	GAG	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849372
91	NC_019975	TGA	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849372
92	NC_019975	TGA	2	6	6900	6905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849372
93	NC_019975	AGC	2	6	6926	6931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849372
94	NC_019975	TC	3	6	7042	7047	0 %	50 %	0 %	50 %	435849372
95	NC_019975	AAAG	2	8	7053	7060	75 %	0 %	25 %	0 %	435849372
96	NC_019975	GC	3	6	7070	7075	0 %	0 %	50 %	50 %	435849372
97	NC_019975	GTG	2	6	7089	7094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849372
98	NC_019975	CG	3	6	7318	7323	0 %	0 %	50 %	50 %	435849373
99	NC_019975	TTCGA	2	10	7416	7425	20 %	40 %	20 %	20 %	435849373
100	NC_019975	GAA	2	6	7463	7468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849373
101	NC_019975	A	6	6	7499	7504	100 %	0 %	0 %	0 %	435849373
102	NC_019975	GC	3	6	7505	7510	0 %	0 %	50 %	50 %	435849373
103	NC_019975	GAC	2	6	7517	7522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849373
104	NC_019975	ACT	2	6	7591	7596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849373
105	NC_019975	ACG	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849373
106	NC_019975	CGA	3	9	7647	7655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849374
107	NC_019975	GGAC	2	8	7671	7678	25 %	0 %	50 %	25 %	435849374
108	NC_019975	CGA	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849374
109	NC_019975	CGA	2	6	7800	7805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849374
110	NC_019975	CTGT	2	8	8413	8420	0 %	50 %	25 %	25 %	435849375
111	NC_019975	CGT	2	6	8440	8445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849375
112	NC_019975	CA	3	6	8514	8519	50 %	0 %	0 %	50 %	435849375
113	NC_019975	CGT	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849375
114	NC_019975	GCG	2	6	8558	8563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849375
115	NC_019975	GCA	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849375
116	NC_019975	CTG	2	6	8611	8616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849375
117	NC_019975	TCA	2	6	8624	8629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849375
118	NC_019975	CTC	2	6	8703	8708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849375
119	NC_019975	AAG	2	6	8717	8722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849375
120	NC_019975	AAC	2	6	8753	8758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849375
121	NC_019975	GCA	2	6	8772	8777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849375
122	NC_019975	CAA	2	6	8789	8794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849375
123	NC_019975	CCGTCC	2	12	8852	8863	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	435849375
124	NC_019975	TGA	2	6	8865	8870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849375
125	NC_019975	A	7	7	9397	9403	100 %	0 %	0 %	0 %	435849376
126	NC_019975	CCCGA	2	10	9405	9414	20 %	0 %	20 %	60 %	435849376
127	NC_019975	AGTT	2	8	9492	9499	25 %	50 %	25 %	0 %	435849376
128	NC_019975	AGA	2	6	9665	9670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849377
129	NC_019975	GAA	2	6	9675	9680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849377
130	NC_019975	GGC	2	6	9711	9716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849377
131	NC_019975	CGACG	2	10	9725	9734	20 %	0 %	40 %	40 %	435849377
132	NC_019975	ACG	2	6	9793	9798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
133	NC_019975	AT	3	6	9806	9811	50 %	50 %	0 %	0 %	435849377
134	NC_019975	AGC	2	6	9868	9873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
135	NC_019975	TCG	2	6	9895	9900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849377
136	NC_019975	GGT	2	6	9990	9995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849377
137	NC_019975	ACG	2	6	10054	10059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
138	NC_019975	AAG	2	6	10143	10148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849377
139	NC_019975	GAG	2	6	10155	10160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849377
140	NC_019975	GCA	2	6	10177	10182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
141	NC_019975	ACG	2	6	10189	10194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
142	NC_019975	AGTC	2	8	10206	10213	25 %	25 %	25 %	25 %	435849377
143	NC_019975	GAC	2	6	10233	10238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
144	NC_019975	GAA	2	6	10259	10264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849377
145	NC_019975	CCG	2	6	10309	10314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849377
146	NC_019975	AAC	2	6	10494	10499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849377
147	NC_019975	GT	3	6	10534	10539	0 %	50 %	50 %	0 %	435849377
148	NC_019975	G	6	6	10584	10589	0 %	0 %	100 %	0 %	435849377
149	NC_019975	CGA	2	6	10601	10606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
150	NC_019975	CGA	2	6	10637	10642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
151	NC_019975	GAAA	2	8	10709	10716	75 %	0 %	25 %	0 %	435849377
152	NC_019975	CGAC	2	8	10753	10760	25 %	0 %	25 %	50 %	435849377
153	NC_019975	TGCT	2	8	10828	10835	0 %	50 %	25 %	25 %	435849377
154	NC_019975	GAC	2	6	10844	10849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
155	NC_019975	GAC	2	6	11001	11006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
156	NC_019975	CGT	2	6	11008	11013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849377
157	NC_019975	GT	3	6	11049	11054	0 %	50 %	50 %	0 %	435849377
158	NC_019975	GGT	2	6	11164	11169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849377
159	NC_019975	CAC	2	6	11270	11275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849377
160	NC_019975	GCT	2	6	11375	11380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849377
161	NC_019975	ACG	2	6	11383	11388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
162	NC_019975	ACG	2	6	11497	11502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
163	NC_019975	CGC	2	6	11518	11523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849377
164	NC_019975	AGC	2	6	11539	11544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
165	NC_019975	GT	3	6	11573	11578	0 %	50 %	50 %	0 %	435849377
166	NC_019975	GAC	2	6	11582	11587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
167	NC_019975	GA	3	6	11596	11601	50 %	0 %	50 %	0 %	435849377
168	NC_019975	CGCAG	2	10	11738	11747	20 %	0 %	40 %	40 %	435849377
169	NC_019975	CGA	2	6	11753	11758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
170	NC_019975	CAG	2	6	11847	11852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
171	NC_019975	TGA	2	6	11930	11935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849377
172	NC_019975	GT	3	6	12004	12009	0 %	50 %	50 %	0 %	435849377
173	NC_019975	TG	3	6	12034	12039	0 %	50 %	50 %	0 %	435849377
174	NC_019975	TCG	2	6	12048	12053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849377
175	NC_019975	ACACT	2	10	12077	12086	40 %	20 %	0 %	40 %	435849377
176	NC_019975	ACCG	2	8	12102	12109	25 %	0 %	25 %	50 %	435849377
177	NC_019975	GAG	2	6	12111	12116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849377
178	NC_019975	TCGG	2	8	12289	12296	0 %	25 %	50 %	25 %	435849377
179	NC_019975	AAC	2	6	12327	12332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849377
180	NC_019975	CGA	2	6	12383	12388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
181	NC_019975	TGG	2	6	12485	12490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849377
182	NC_019975	CGA	2	6	12506	12511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
183	NC_019975	GCT	2	6	12702	12707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849377
184	NC_019975	ACGG	2	8	12708	12715	25 %	0 %	50 %	25 %	435849377
185	NC_019975	CTA	2	6	12733	12738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849377
186	NC_019975	GAA	2	6	12755	12760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849377
187	NC_019975	GGC	2	6	12869	12874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849377
188	NC_019975	ATTA	2	8	12921	12928	50 %	50 %	0 %	0 %	435849377

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.